Lohta városában minden évben látványos torna keretében ünneplik meg Aaron, a Hullámvezető Hőst, akiről azt tartják, hogy évszázadokkal ezelőtt egy speciális erő segítségével véget vetett a hosszú háborúnak. A versenyre Satoshi és Pikatchu is benevez, és meg is nyerik azt, ám ekkor feltűnik egy fantom Pokémon és elragadja Pikatchut. Nem sokkal később Lucario, a Hullámvezető Pokemon kiszabadul évszázados börtönéből, és megjelenik Satoshi előtt, akinek rejtélyek egész sorozatát kell megoldania ahhoz, hogy meglelje Pikatchu nyomát.