Az 1992-ben kiadott X-Men animációs sorozat folytatása. X professzor halálát követően Rozsomák és Vihar próbálják összeszedni a csapatot és folytatni vezetőjük örökségét. Eközben Magneto magának követeli a mutánsok vezetésének jogát, Sinister pedig szeretné végleg elpusztítani a szuperhősöket.