A sorozatot Joseph Mallozzi és Paull Millie, a Stargate SG-1 franchise írói és producerei veszik a kezükbe, a forgatókönyvet pedig saját képregényük, a Dark Horse Comics által kiadott Dark Matter alapján írják. A történet szerint egy elhagyott űrhajón a hatfős legénység tagjai úgy ébrednek fel a hibernációból, hogy semmire nem emlékeznek. Nemhogy arra, hogy hogyan kerültek a hajóra, de még a saját nevükre sem. Együtt indulnak tehát felfedező útra, miközben egymást és sötét múltjukat is megismerik.