A sorozat egy New York-i terrortámadás utáni nyomozást mutat be. A történet két idősíkon játszódik: a jelen - a Grand Central állomáson történt terroristatámadás - és a múlt - egy 20 hetes kiképzés a Quanticóban található FBI Akadémián - közötti váltások során ismerjük meg hét FBI újonc életét. A fiatalok teljesítőképességük határára kerülnek, miközben egyre többen morzsolódnak le közülük, egészen addig, amíg csak a legjobb jelöltek maradnak. Alex Parrish - akit nem hagynak nyugodni az elhunyt édesapjával és rejtélyes ügynöki karrierjével kapcsolatos kérdések ? csatlakozik az FBI-hoz, hogy válaszokat kapjon. Társai között találjuk Ryan Booth-t (egykori katona), Shelby Wyattet (egy elárvult úri kisasszony), Eric Packert (egy zűrös múltú mormon hívő), Simon Ashert (az első nyilvánosan homoszexuális újonc), Nimah Amint (egy hithű muzulmán, aki kettős életet él) és Caleb Haast (aki számára az FBI egy családi vállalkozás). Kiképző tisztjeik - Miranda Shaw és Liam O'Connor - nagy tapasztalatra tettek szert az akadémián, de viszonyuk nem súrlódásmentes sem a hivatallal, sem pedig egymással. Amikor Alex Parrish megtudja, hogy őt vádolják egy terrorista támadás elkövetésével, menekülnie kell, s megpróbálja még azelőtt kideríteni, hogy melyik egykori évfolyamtársa az igazi terrorista, hogy az újból lecsapna.